Analysér data: DNA & liv i dit drikkevand

Miljø-DNA, også kaldet eDNA, kan afsløre biodiversiteten i utallige forskellige miljøer lige fra havvand til iskerneboringer og støvet under vores seng. I efteråret 2015 arbejdede vi DNA & liv med undersøgelser af eDNA i postevand. Elever fra hele landet indsamlede og opformerede eDNA-prøver fra gymnasiernes vandhaner.

Professor Rob Dunn, som analyserer resultaterne siger:

"In the tap water of Denmark we have rather remarkable discovery, a discovery initiated by students. Nearly all of the major branches of the tree of life (including several dozen bacterial phyla and all the archea) are present in the Danish tap water, which also so happens to be (I think) the most diverse tap water ever studied.

Among the most fun critters you all drank today is this one, the so-called platypus of microbiology. Really wondrous beast. Also common was this crazy micro worm."

Vi stiller alt sekvens-data fra projektet til rådighed, så du kan benytte det i din undervisning og selv lede efter endnu flere arter. Skriv til os og få tilsendt data og vejledning til, hvordan du analyserer data.

Der er liv i dit drikkevand

Projektidéen tog udgangspunkt i undersøgelser af postevand fra Holland, USA og Danmark, hvor man havde fundet bl.a. bakterier og adskillige dyrearter, herunder protozoer, fladorme, rundorme, ledorme og krebsdyr. Med de nye molekylærbiologiske metoder til at indsamle og analysere miljø-DNA (eDNA) havde vi en enestående mulighed for, sammen med gymnasier fra hele landet, at få et bedre overblik over hvilke organismer, der findes i postevand og drikkevandsledningerne.

Postevand i Danmark

I Danmark anvender vi stort set kun urenset grundvand til drikkevand, og det er kun sjældent nødvendigt at benytte kloring eller anden bearbejdning af vandet. Desuden er den danske undergrund, som leverer vandet, meget forskellig på tværs af landet. Danmark er således et godt sted at undersøge sammensætningen af bakterier og eukaryoter i drikkevandet og hvorledes det afhænger af fx geografisk placering, afstand til vandværk, årstid, vandbehandling mv.

Lad dine elever analysere resultaterne

Med den analysemetode vi benyttede til at opformere DNA fra postevand, var det ikke muligt for de deltagende klasser at få resultaterne samme dag; PCR-produkterne blev nemlig sendt til USA til sekvensering og bioinformatisk analyse. Derfor deler vi her det samlede datasæt - ikke bare med de deltagende klasser - men med alle interesserede lærere, klasser og elever. På den måde vil vi gerne invitere eleverne med indenfor i forskernes maskinrum, og give dem mulighed for at prøve kræfter med autentiske bioinformatiske analysemetoder.